VKS
PhD Research · Computational Biology · Drug Discovery

ಸಂಶೋಧನಾ ಕೌಶಲ್ಯಗಳು

ಡಾಕ್ಟರಲ್ ಸಂಶೋಧನೆಯಿಂದ ಬಯೋಇನ್ಫಾರ್ಮಾಟಿಕ್ಸ್ & :ವೆಟ್ ಲ್ಯಾಬ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳು

Research Focus

Bridging computational and experimental cancer research — from AI-driven drug discovery pipelines (SieveAI) and molecular dynamics simulations (coarse-grain MARTINI for membranes, atomistic CHARMM36 for proteins) to cell-based validation assays. Specializing in protein-ligand docking, protein-protein interactions, structure prediction (AlphaFold2, SwissModel, I-TASSER, Rosetta), MMPBSA binding free energy, and exosomal miRNA analysis. Automated workflows from PDB preparation through docking, MD, and result extraction — reducing months of manual work to hours.

ಬಯೋಇನ್ಫಾರ್ಮಾಟಿಕ್ಸ್ & ಕಂಪ್ಯೂಟೇಷನಲ್ ಬಯಾಲಜಿ

ಕಂಪ್ಯೂಟೇಷನಲ್ ಡ್ರಗ್ ಡಿಸ್ಕವರಿ, ಮೊಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್, ಜನೋಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಡೆವಲಪ್‌ಮೆಂಟ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವ. ಬಹು ಓಪನ್-ಸೋರ್ಸ್ ಟೂಲ್‌ಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ.

Protein-Ligand Docking

ಡ್ರಗ್-ಟಾರ್ಗೆಟ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಮುನ್ಸೂಚಿಸಲು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡಾಕಿಂಗ್ — CXCL9/10 ಮತ್ತು SKP2 ನಂತಹ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಗುರಿಗಳಿಗಾಗಿ ಸಂಭಾವ್ಯ ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ಸಾವಿರಾರು ಸಂಯುಕ್ತಗಳನ್ನು ಸ್ಕ್ರೀನ್ ಮಾಡಲು AutoDock Vina, SwissDock ಮತ್ತು PATCHDOCK ಅನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ.

  • AutoDock Vina — batch protein-ligand docking (1,950+ complexes)
  • Protein-protein docking — HADDOCK, pyDockWeb, PatchDock, ClusPro
  • Protein-protein interaction — CD151 cholesterol binding, TWIST1-OGT/OGase, survivin-caspase complexes
  • Protein-complex docking — ternary systems (survivin + OBPHA + caspase-3/7/9)
  • Peptide-peptide docking — TWIST1-OGT/OGase interactions
  • Ligand preparation — AutoDockTools, OpenBabel, PubChemPy 3D SDF, SwissParam topology
  • Post-docking analysis — ChimeraX H-bond/contact automation, PLIP, PRODIGY
  • Cancer targets — CXCL9/10, SKP2, PPARγ, BRCA1, GRK2, CD63-VEGF, p53, Bcl-2, PDGFR
  • DrugBank & FDA drug screening — 8K+ conformers, immune checkpoints (CD28, TIGIT, PD-1)

Molecular Dynamics Simulation

ನ್ಯಾನೊಸೆಕೆಂಡ್ ಟೈಮ್‌ಸ್ಕೇಲ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆ, ಲಿಗಾಂಡ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪಥಗಳು ಮತ್ತು ಕನ್ಫರ್ಮೇಷನಲ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು GROMACS ಮತ್ತು WebGro ಜೊತೆಗೆ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್‌ಗಳು — ಡಾಕಿಂಗ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲು ಇದು ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಮುಖವಾಗಿದೆ.

  • GROMACS — full MD pipeline (pdb2gmx, editconf, solvate, genion, grompp, mdrun) up to 300ns
  • Coarse-grain MD — MARTINI force field for lipid–ligand membrane systems (Lapatinib/DMPC/cholesterol)
  • Atomistic MD — CHARMM36 force field for protein–ligand complexes; AMBER/CHARMM36 for membranes
  • CHARMM-GUI membrane builder — DMPC, DOPC, DOPS, cholesterol bilayer preparation & embedding
  • Desmond MD — local installation & WebGro cloud submission, trajectory analysis
  • MMPBSA — gmx_MMPBSA binding free energy calculations (300ns trajectories)
  • RMSD / RMSF / Rg / SASA / DSSP — protein stability, secondary structure, solvent analysis
  • SwissParam & PRODRG — ligand topology/ITP generation for GROMACS CHARMM force field
  • GMXvg — published GROMACS visualization & plotting tool

Protein Structure Prediction

AlphaFold2, SwissModel, I-TASSER, Rosetta ಜೊತೆಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆ ಊಹೆ — ಮ್ಯೂಟೆಂಟ್ ಮಾಡೆಲಿಂಗ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಊಹೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೋಲಿಕೆ (RMSD) ಸೇರಿದಂತೆ.

  • AlphaFold2 — protein structure prediction via Google Colab (IL27 complex, CD151, CD63)
  • SwissModel — homology modeling + QA (quality assessment) for mutant proteins (3EQH-ALA76GLY)
  • I-TASSER — 3D structure prediction for membrane & transmembrane proteins
  • Rosetta — protein structure prediction and design
  • Avogadro — energy minimization of small molecules & ligand 3D optimization
  • Protein structure comparison — ChimeraX Matchmaker (RMSD, primary/secondary/tertiary structure)
  • PDB processing — UniProt mapping, PDBTM for transmembrane, chain cleanup, HETATM separation
  • O-GlcNAcylation site prediction — YinOYang, dbPTM, PhosphoSitePlus for GRK2 sites (S20, S121, S370)
  • Membrane protein resources — PDBTM, TMDock, MemProtMD, PerMemDB, MBPpred, ProteinTools

ಜನೋಮಿಕ್ಸ್ & ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್

GEOParse ನೊಂದಿಗೆ GEO ಡೇಟಾಸೆಟ್‌ಗಳನ್ನು ಮೈನಿಂಗ್ ಮಾಡುವುದು, RNA-Seq ಮತ್ತು ncRNA ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು, ಕ್ಯಾನ್ಸರ್‌ನಲ್ಲಿ ಅನಿಯಂತ್ರಿತ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಕ ಜಾಲಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪಾಥ್‌ವೇ ಎನ್ರಿಚ್‌ಮೆಂಟ್ ಮತ್ತು GO ಟಿಪ್ಪಣಿಯನ್ನು ಮಾಡುವುದು.

  • GEO dataset mining — GEOParse querying, GDS database search, sample/platform/series filtering (GSE15852, GSE73002, GSE77348)
  • Differential gene expression — PyDGE framework, MCF7 vs MCF10A, normal vs tumor expression analysis
  • TCGA cancer genomics — GDC portal data download (gdc-client), TCGA-BRCA miRNA-seq, TNBC cohort filtering, sample type codes
  • miRNA database consolidation — miRBase (2,693 mature), ExoCarta, EVmiRNA, miRCancer cross-referencing & Venn analysis
  • miRNA target prediction — TargetScan, miRDB, DIANA, miRWalk, miRTarBase validated targets
  • Exosomal miRNA analysis — miR-34a, miR-10b, miR-21, miR-9; ExoLoger prediction database
  • ncRNA analysis — lncRNA, circRNA, siRNA, piRNA; RNAComposer, UNAFold, MXfold2 for 3D structure
  • Pathway & network analysis — KEGG (KEGGScape), WikiPathways, Biocarta, STRING interaction networks, FunRich enrichment
  • NCBI/Entrez queries — PubMed search, GDS metadata extraction, Gene database cross-referencing
  • Cancer gene resources — IntOGen (BRCA driver genes), cBioPortal, OncoKB, COSMIC, CancerES (IIITD)
  • PTM databases — dbPTM, PhosphoSitePlus, O-GlcNAc (oglcnac.mcw.edu), VerSeDa

Drug Discovery Pipeline

SieveAI ಅನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಚ್‌ನಲ್ಲಿ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್, ಡಾಕಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಸ್ಕೋರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಸಂಘಟಿಸುವ ಒಂದು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಔಷಧ ಆವಿಷ್ಕಾರ ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಆಗಿದೆ — ಇದು ತಿಂಗಳುಗಳ ಕೈಯಾರೆ ಮಾಡುವ ಕೆಲಸವನ್ನು ಗಂಟೆಗಳಿಗೆ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. Zenodo DOI ಯೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಓಪನ್-ಸೋರ್ಸ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.

  • SieveAI — end-to-end automated drug discovery pipeline: PDB prep → ligand prep → docking → result extraction → filtering
  • Bulk docking automation — 576 cancer genes × 5 ligands = 1,950+ complexes; 9,127 Vina results parsed & filtered
  • DrugBank high-throughput screening — GRK2 (3,894 complexes ~60h compute), immune checkpoints (8K+ conformers)
  • Automated PDB processing — Python scripts for ATOM/HETATM separation, chain cleanup, grid box calculation, PDBQT conversion
  • Bulk ligand preparation — AutoDockTools prepare_ligand4.py, OpenBabel batch PDB→SDF→SMILES, PubChemPy 3D SDF download
  • Automated result extraction — Vina score parsing, ChimeraX H-bond/contact command generation, best-pose selection by residue interaction
  • SwissADME bulk — automated SMILES submission, ADME radar scraping, property aggregation across 88+ compounds
  • MDDAA-Mate — docking analysis assistant for validation & cross-checking against published results

Bioinformatics Data Mining

PubMed ಸಾಹಿತ್ಯ ಮೈನಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ ಕಸ್ಟಮ್ ಸ್ಕ್ರಾಪಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್‌ವರ್ಕ್‌ಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮೆಟಾ-ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ವಿಮರ್ಶೆಗಳಿಗಾಗಿ ಸಾವಿರಾರು ಅಬ್‌ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ವೆಬ್ ಮೂಲಗಳಿಂದ ರಚನಾತ್ಮಕ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ.

  • PubMed querying & full-text mining — biopubmed CLI tool
  • Scientific literature meta-analysis — systematic review automation
  • Web scraping framework (Scrapper) — GEO, DrugBank, UniProt, ZINC, PubChem data extraction
  • API integration — PubChemPy 3D SDF download, RCSB ligand fetch, KEGG KGML pathway
  • miR literature curation — exosomal miR article classification & filtering

Biomedical Text Mining

ಸಂಶೋಧನಾ ಅಬ್‌ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್‌ಗಳಿಂದ ಹೆಸರಿಸಲಾದ ಘಟಕ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ (NER) ಮತ್ತು ಕೀವರ್ಡ್ ಸಹ-ಸಂಭವನೀಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಬಯೋಮೆಡಿಕಲ್ NLP — ದೊಡ್ಡ ಸಂಗ್ರಹಗಳಿಂದ ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಸಾಹಿತ್ಯ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಕಲ್ಪನೆ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.

  • Biomedical NLP — keyword co-occurrence, named entity recognition, spaCy POS/lemma extraction
  • Text mining — structured extraction from thousands of PubMed results
  • Exosomal miR prediction — NLP + clustering for unvalidated miR identification
  • Regex-based data extraction — SMILES conversion, gene ID mapping, UniProt batch queries

Machine Learning for Bioinformatics

ಕಠಿಣ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನದೊಂದಿಗೆ (AUC, F1, MCC) ರಾಂಡಮ್ ಫಾರೆಸ್ಟ್, SVM ಮತ್ತು XGBoost ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಪೂರಕವಾಗಿರುವ SMILES/SMARTS ಬೆರಳಚ್ಚುಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮೆಟಾಬೊಲೈಟ್ ವರ್ಗೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ ಡೀಪ್ ನ್ಯೂರಲ್ ನೆಟ್‌ವರ್ಕ್‌ಗಳು (DNN).

  • DNN for metabolite classification — SMILES/SMARTS fingerprinting
  • Random Forest / SVM / XGBoost — cancer gene expression classifiers
  • Model evaluation — AUC, F1, MCC metrics
  • PCA & one-hot encoding — miRNA sequence analysis & dimensionality reduction

Research Software & Tools

ಕಂಪ್ಯೂಟೇಷನಲ್ ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ ಪರಿಕರಗಳನ್ನು ಬರೆದು ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ — SieveAI (ಔಷಧ ಆವಿಷ್ಕಾರ), ExoLoger (ಎಕ್ಸೋಸೋಮಲ್ miRNA ಮುನ್ಸೂಚನೆ), GMXvg (GROMACS ದೃಶ್ಯೀಕರಣ, Zenodo DOI), miRvim (3D miRNA ರಚನೆ ಡೇಟಾಬೇಸ್), ಮತ್ತು UtilityLib (ಪೈಥಾನ್ ಯುಟಿಲಿಟಿಗಳು, Zenodo DOI).

  • SieveAI — automated drug discovery pipeline
  • ExoLoger — exosomal miRNA prediction database
  • GMXvg — GROMACS visualization & plotting
  • miRVim — 3D miRNA structure database
  • UtilityLib — Python utility library (PyPI v2.21.4)
  • TheBiomics — Drupal education platform (17K+ users)
  • biopubmed — PubMed scraping & processing CLI
  • Scrapper — scientific web data extraction framework
  • MDDAA-Mate — docking analysis assistant & validation tool
  • PyDGE — differential gene expression analysis framework

ವೆಟ್ ಲ್ಯಾಬ್ & ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ

ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಬಯಾಲಜಿ ಮತ್ತು ಫಾರ್ಮಕಾಲಜಿಯಲ್ಲಿ ಸೆಲ್ ಕಲ್ಚರ್, ಮೊಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ ಅಸೇಯ್‌ಗಳು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೆಲಸ ಮತ್ತು ಇನ್ ವಿಟ್ರೋ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಅನುಭವ.

ಸೆಲ್ ಕಲ್ಚರ್ & ನಿರ್ವಹಣೆ

ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾದ ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ತಂತ್ರದೊಂದಿಗೆ ಸಸ್ತನಿ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳನ್ನು (MG63, MCF7, MM231, LN229) ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗಿದೆ — ಇದರಲ್ಲಿ ಕ್ರಯೋಪ್ರೆಸರ್ವೇಶನ್, ಸಬ್-ಕಲ್ಚರಿಂಗ್, ಪ್ಯಾಸೇಜಿಂಗ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಫೆಕ್ಷನ್ ಆಪ್ಟಿಮೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ಮೈಕೋಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಪರೀಕ್ಷೆ ಸೇರಿವೆ.

  • Mammalian cell culture — MG63, MCF7, MDA-MB-231, LN229, A549
  • Animal cell culture — aseptic technique, laminar flow hood, CO₂ incubator operation
  • Cell line maintenance — sub-culturing, passaging, cell counting (hemocytometer), viability assessment
  • Cryopreservation — liquid nitrogen storage, freeze-thaw recovery, DMSO cryoprotectant protocols
  • Transfection optimization — lipid-based and electroporation methods
  • Mycoplasma testing & contamination control
  • Cancer cell to adipocyte differentiation (PPARγ agonist studies)

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಂದಾಜು & ಅಸೇಯ್‌ಗಳು

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣ (ಬ್ರಾಡ್‌ಫೋರ್ಡ್, BCA), SDS-PAGE ಮತ್ತು ವೆಸ್ಟರ್ನ್ ಬ್ಲಾಟಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ಬೇರ್ಪಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುವಿಕೆ, ಮತ್ತು ELISA ಮತ್ತು ಸಹ-ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.

  • Protein estimation — Bradford & BCA assay (standard curve preparation)
  • SDS-PAGE & Western blotting — Vimentin, target protein detection
  • Wet blot transfer — tank transfer system for protein membrane immobilization
  • Dry blot transfer — semi-dry transfer for rapid protein detection
  • Gel Doc imaging — documentation & analysis of electrophoresis gels and blots
  • ELISA — quantitative protein interaction analysis
  • Co-immunoprecipitation — protein-protein interaction validation
  • A280 protein quantification

ಮೊಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ ಟೆಕ್ನಿಕ್‌ಗಳು

ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಬಯಾಲಜಿ ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋ — TRIzol ನೊಂದಿಗೆ RNA ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ, cDNA ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ, ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗಾಗಿ qPCR/RT-PCR, ಅಗರೋಸ್ ಜೆಲ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್, ಮತ್ತು ಕ್ಲೋನಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೈಮರ್ ವಿನ್ಯಾಸದೊಂದಿಗೆ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕೀಕರಣ.

  • RNA extraction — TRIzol method
  • cDNA synthesis & gene expression analysis
  • RT-PCR & qPCR — reverse transcription, quantitative expression profiling
  • Agarose gel electrophoresis — nucleic acid separation & Gel Doc visualization
  • Plasmid isolation, cloning & primer design
  • Competent cell transformation

ಇನ್ ವಿಟ್ರೋ ಅಧ್ಯಯನಗಳು

ಔಷಧ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ ಜೀವಕೋಶ-ಆಧಾರಿತ ಅಸೇಯ್‌ಗಳು — MTT/XTT ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯತೆ, ಕಾಲೋನಿ ರಚನೆ, ಗಾಯ ಗುಣಪಡಿಸುವ ವಲಸೆ, ಆಕ್ರಮಣಕಾರಿ ಅಸೇಯ್‌ಗಳು, ಅಪೊಪ್ಟೋಸಿಸ್ ಪತ್ತೆ (ಅನೆಕ್ಸಿನ್ V), ಮತ್ತು ಔಷಧ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಸಿನರ್ಜಿ (CI ಸೂಚ್ಯಂಕ).

  • MTT & XTT viability assays — dose-response drug screening, IC₅₀ determination
  • Colony formation assay — clonogenic survival quantification
  • Wound healing migration assay — scratch assay for cell motility
  • Invasion assays — transwell migration & Matrigel invasion
  • Apoptosis detection — Annexin V / PI staining
  • Drug combination synergy — Combination Index (CI) method
  • Cancer cell vs normal cell comparative studies

Instruments & Equipment

ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿ, ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಕ್ರೊಮಟೋಗ್ರಫಿ ಕಾರ್ಯಹರಿವುಗಳಿಗಾಗಿ ಲ್ಯಾಬ್ ಉಪಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಸಾಧನಗಳು.

  • Gel Doc system — gel documentation, blot imaging & densitometry analysis
  • CO₂ incubator — mammalian cell culture environment control
  • Laminar flow hood — aseptic technique & sterile workspace
  • Microplate reader — absorbance/fluorescence for MTT, Bradford, BCA, ELISA
  • Centrifuge — refrigerated & bench-top, cell pelleting, fractionation
  • PCR thermal cycler — RT-PCR & qPCR amplification
  • Electrophoresis apparatus — vertical SDS-PAGE & horizontal agarose gel
  • Wet & dry blot transfer systems — tank & semi-dry protein transfer
  • HPLC system — basic operation & familiarization with analytical chromatography devices

ಕ್ರೊಮಟೋಗ್ರಫಿ & HPLC

ಸಂಯುಕ್ತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಶುದ್ಧತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ HPLC ಕಾರ್ಯಾಚರಣೆ ಮತ್ತು ವಿಧಾನ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ, ಜೊತೆಗೆ ಕಾಲಮ್ ಮತ್ತು ತೆಳುವಾದ-ಪದರದ ಕ್ರೊಮಟೋಗ್ರಫಿ ತಂತ್ರಗಳು.

  • Chromatography basics — column, thin-layer & basic HPLC familiarization
  • Column & thin-layer chromatography
  • Standard curve & peak integration